Felipe P.G. Bergo

Laboratório de Informática Visual, Instituto de Computação, Unicamp, Brasil. 

Mestre em Ciência da Computação pela Unicamp (2004), Doutor em Ciência da Computação (2004-2008).
Pesquisador associado do Laboratório de Neuroimagem - Depto. de Neurologia - FCM - Unicamp (2009-presente).

Áreas de Pesquisa: Processamento de imagens, imagens médicas, computação Gráfica.

Currículo Lattes

Última atualização desta página: Julho de 2012.



Cursos - Software - Apresentações - Posters - Publicações/Prêmios


Cursos:

MC102C - 2s07 - Algoritmos e Programação de Computadores
MC102E - 1s07 - Algoritmos e Programação de Computadores
MC102QR - 2s06 - Algoritmos e Programação de Computadores
MC202B - 1s06 - Estruturas de Dados
MC102EF - 2s05 - Algoritmos e Programação de Computadores


Software:

SpineSeg - Spinal Cord Segmentation
Segmentação semi-automatica para avaliação de atrofia da medula. Para Linux, *BSD, Mac OS X. Código fonte aberto, disponibilizado sob licença GNU GPL. 		SpineSeg
Aftervoxel - 3D Medical Image Visualization
Leitura, visualização e conversão de imagens médicas 3D, para Linux. 		Aftervoxel   Aftervoxel
IVS - Interactive Volume Segmentation
Visualização e Segmentação semi-automática de imagens médicas volumétricas (Ressonância Magnética, Tomografia Computadorizada), para Linux. 		IVS   IVS   IVS
eboard
Cliente gráfico para servidores de xadrez (ICS) e programas de xadrez (chess engines). Para Linux, Solaris, *BSD. Compilável em Mac OS X e Windows+Cygwin para quem tiver paciência. Código aberto, disponibilizado sob licença GNU GPL. 		eboard eboard


Apresentações:


Image Segmentation by Tree Pruning, 19/Out/2004, SIBGRAPI'2004, Curitiba-PR
Segmentação Automática do Cérebro com Operadores Baseados em Grafos, 15/Set/2005, Seminário LNI, FCM-Unicamp, Campinas-SP
Detecção de Displasias em Imagens de Ressonância Magnética do Cérebro Humano, 21/Fev/2006, Exame de Qualificação, IC-Unicamp, Campinas-SP

Detecção de Lesões Displásticas em Imagens de Ressonância Magnética do Cérebro Humano, 30/Out/2006, Seminário LIV, IC-Unicamp, Campinas-SP
Detecção e Localização de Displasias em Imagens de Ressonância Magnética do Cérebro Humano, 1/Dez/2006, II Workshop de Teses e Dissertações, IC-Unicamp, Campinas-SP
Classificador de Padrões para Displasias, 4/Dez/2006, MO445 (Análise de Imagens), IC-Unicamp, Campinas-SP

Detecção Automática de Displasias Corticais Focais no Cérebro Humano a partir de Imagens de Ressonância Magnética, 15/Mar/2007, Seminário LNI, FCM-Unicamp, Campinas-SP
A Partitioned Algorithm for the Image Foresting Transform, 13/Out/2007, 8th Intl. Symp. Mathematical Morphology, Rio de Janeiro-RJ
Detecção e Localização de Displasias em Imagens de Ressonância Magnética do Cérebro Humano, 21/Nov/2007, III Workshop de Teses e Dissertações, IC-Unicamp, Campinas-SP

Fast and Robust Mid-Sagittal Plane Location in 3D MR Images of the Brain, 28/Jan/2008, Biosignals 2008, Funchal, Portugal
Defesa de doutorado: Segmentação de FCDs em imagens de RM do Cérebro Humano, 2/Abr/2008, IC-Unicamp, Campinas-SP
Focal Cortical Dysplasia Segmentation in 3D Magnetic Resonance Images of the Human Brain, 20/Jul/2009, CSBC 2009 (Concurso de Teses e Dissertações), Bento Gonçalves-RS

Accurate and Precise Mid-Sagittal Plane Location in 3D MR Images of the Brain, 07/Ago/2009, III Workshop Cinapce, Ribeirão Preto-SP


Posters:


SPIE Medical Imaging 2003, Fev/2003, San Diego, CA, USA
IEEE Biomedical Imaging 2006, Abr/2006, Arlington, VA, USA
IEEE Biomedical Imaging 2008, Mai/2008, Paris, França

WTD SIBGRAPI 2009, Out/2009, Rio de Janeiro, Brasil
63rd American Academy of Neurology Meeting, Abr/2011, Honolulu, HI, USA
V Workshop CInAPCe, Ago/2011, São Paulo, Brasil


Publicações/Prêmios:

Prêmios:

  1. 1º Lugar (Categoria Tese de Doutorado) no XXII Concurso de Teses e Dissertações do XXIX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação. Bento Gonçalves, RS, Jul/2009.
  2. Menção Honrosa no Prêmio CAPES de Teses 2009 (Área: Ciência da Computação, divulgado em Nov/2010) ([Listagem de Premiados] [Nota no site da Unicamp])

Dissertações/Teses:

  1. Mestrado/M.Sc: F.P.G. Bergo, Segmentação Interativa de Volumes Baseada em Regiões , Feb 2004, Instituto de Computação, Unicamp, Campinas, SP, Brazil (98 pages).
  2. Doutorado/Ph.D: F.P.G. Bergo, Segmentação de Displasias Corticais Focais em Imagens de Ressonância Magnética do Cérebro Humano , Apr 2008, Instituto de Computação, Unicamp, Campinas, SP, Brazil (114 pages).

Periódicos

  1. C.F. Chevis, C.B. da Silva, A. d'Abreu, I. Lopes-Cendes, F. Cendes, F.P.G. Bergo, M.C. França Jr., Spinal Cord Atrophy Correlates with Disability in Friedreich's Ataxia, Cerebellum, 12(1), Feb 2013, pp. 43-47
  2. M.L.F. Balthazar, C.L. Yasuda, F.R.S. Pereira, F.P.G. Bergo, F. Cendes, B.P. Damasceno, Coordinated and circumlocutory semantic naming errors are related to anterolateral temporal lobes in mild AD, aMCI and normal aging, Journal of the International Neuropsychological Society (JINS), 16(6), Nov 2010, pp.1099-1107
  3. P.A.V. Miranda, A.X. Falcão, A. Rocha, F.P.G. Bergo, Object delineation by κ-Connected Components, EURASIP Journal on Advances in Signal Processing, Jun 2008
  4. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, P.A.V. Miranda, L.M. Rocha, Automatic Image Segmentation by Tree Pruning, Journal of Mathematical Imaging and Vision, 29(2-3), Nov 2007, pp.141-162
  5. A.X. Falcão, F.P.G. Bergo, Interactive volume segmentation with differential image foresting transforms, IEEE Transactions on Medical Imaging, 23(9), Sep 2004, pp.1100-1108

Capítulos de Livros:

  1. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, C.L. Yasuda, G.C.S. Ruppert, Fast, Accurate and Precise Mid-Sagittal Plane Location in 3D MR Images of the Brain, in:Biomedical Engineering Systems and Technologies (International Joint Conference, BIOSTEC 2008 Funchal, Madeira, Portugal, January 28-31, 2008 Revised Selected Papers), Eds: A.Fred, J.Filipe, H. Gamboa, CCIS vol. 25, Springer, Berlin, ISBN 978-3-540-92219-3, pp. 278-290, 2009
  2. A.X. Falcão, F.P.G. Bergo, F.O. Favretto, G.C.S. Ruppert, P.A.V. Miranda, F.A.M. Cappabianco, Processamento, Visualização e Análise de Imagens Anatômicas do Cérebro Humano [cópia local] , in:Neurociências e Epilepsia, Eds: L.M. Li, P.T. Fernandes, R.J.M. Covolan, F. Cendes, Ed. Plêiade, São Paulo, ISBN 978-85-7651-080-2, pp. 97-124, 2008

Conferências

  1. F.P.G. Bergo, M.C. França Jr, C.F. Chevis, F. Cendes, SpineSeg: A Segmentation and Measurement Tool for Evaluation of Spinal Cord Atrophy, CISTI'2012 (7ª Conferencia Ibérica de Sistemas y Tecnologia de Información), Jun 2012, Madrid, Spain, vol. 2, pp. 400-403
  2. G.C.S. Ruppert, F.O. Favretto, A.X. Falcão, C.L. Yasuda, F.P.G. Bergo, Fast and Accurate Image Registration Using the Multiscale Parametric Space and Grayscale Watershed Transform [cópia local] , IWSSIP'2010 (17th Intl. Conf. on Systems, Signals and Image Proc.), Jun 2010, Niterói, RJ, Brazil, pp. 457-460
  3. F.O. Favretto, F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, A Fast and Automatic Method for 3D Rigid Registration of MR Images of the Human Brain, SIBGRAPI'2008, Oct 2008, Campo Grande, MS, Brazil, pp. 121-128
  4. F.P.G. Bergo, A.X.Falcão, C.L. Yasuda, F. Cendes, FCD Segmentatation using Texture Asymmetry of MR-T1 Images of the Brain, 5th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2008), May 2008, Paris, France, pp. 424-427
  5. F.P.G. Bergo, G.C.S. Ruppert, L.F. Pinto, A.X. Falcão, Fast and robust mid-sagittal plane location in 3D MR images of the brain, Intl. Conf. on Bio-inspired Systems and Signal Proc (BIOSIGNALS 2008), Jan 2008, Funchal, Portugal, pp. 92-99
  6. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, A Partitioned Algorithm for the Image Foresting Transform, 8th Intl. Symposium Mathematical Morphology (ISMM'07), Oct 2007, Rio de Janeiro, RJ, Brazil, pp. 425-436.
  7. P.A.V. Miranda, F.P.G. Bergo, L.M. Rocha, A.X. Falcão, Tree-pruning: A New Algorithm and its Comparative Analysis with the Watershed Transform for Automatic Image Segmentation, SIBGRAPI'2006, Oct 2006, Manaus, AM, Brazil, pp. 37-44.
  8. F. de Goes, F.P.G. Bergo, A.X.Falcão, S. Goldenstein, L. Velho, Adapted Dynamic Meshes for Deformable Surfaces, SIBGRAPI'2006, Oct 2006, Manaus, AM, Brazil, pp. 213-220.
  9. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, Fast and Automatic Curvilinear Reformatting of MR Images of the Brain for Diagnosis of Dysplastic Lesions, 3rd IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI'2006), Apr 2006, Arlington, VA, USA, pp. 486-489
  10. A.X. Falcão, P.A.V. Miranda, A. Rocha, F.P.G. Bergo, Object Detection by K-Connected Seed Competition, Proc. 18th Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing (SIBGRAPI), Oct 2005, Natal, RN, Brazil, pp. 97-104
  11. A.X. Falcão, F.P.G. Bergo, P.A.V. Miranda, Image segmentation by tree pruning, Proc. 17th Brazilian Symposium on Computer Graphics and Image Processing (SIBGRAPI), Oct 2004, Curitiba, PR, Brazil, pp. 65-71
  12. A.X. Falcão, F.P.G. Bergo, The Iterative Image Foresting Transform and its application to User-steered 3D segmentation, SPIE Medical Imaging, Feb 2003, San Diego, CA, USA, pp. 1464-1475

Resumos

  1. B.H.B. Silva, R. Guimaraes, F. Bergo, M. Franca, A. d'Abreu, I. Lopes-Cendes, F. Cendes, MRI T2-Relaxometry in Spinocerebellar Ataxia Type 3 (Machado-Joseph Disease), 64th American Academy of Neurology Meeting, Apr 2012, New Orleans, LA, P05.024 (poster)
  2. C.B. Silva, F.P.G. Bergo, A. d'Abreu, I. Lopes-Cendes, M.C. França Jr., T2 Relaxation Time Correlates with Disease Severity in Friedreich's Ataxia, 64th American Academy of Neurology Meeting, Apr 2012, New Orleans, LA, P05.012 (poster)
  3. F.P.G. Bergo, W.M. Avelar, F. Cendes, LNIDB: An Image Archival, Retrieval and Visualization System for Medical Imaging Research Centers, V Workshop CinAPCe, Aug 2011, São Paulo, SP, Brasil.
  4. C.F. Chevis, M.C. França Jr., F.P.G. Bergo, A. D'Abreu, R.P. Guimarães, I. Lopes-Cendes, F. Cendes, Distinct Patterns of Spinal Cord Atrophy in Machado-Joseph Disease and Friedreich's Ataxia 63rd American Academy of Neurology Meeting, Apr 2011, Honolulu, HI, USA, P05.147 (poster)
  5. C.L. Yasuda, F.A.M. Cappabianco, F.R.S. Pereira, A.L.F. Costa, A.V. Saude, F.P.G. Bergo, A.C. Coan, L.E. Betting, F.Cendes, VBM and Cortical analysis in patients with focal cortical dysplasia reveal areas with widespread GM abnormalities in cortex and cerebellum, IV Workshop CinAPCe, Aug 2010, São Carlos, SP, Brasil, poster 171
  6. M. França Jr., F.P.G. Bergo, A. D'Abreu, L. Bonadia, M. Silva, I. Lopes-Cendes, F. Cendes, Spinal Cord Atrophy Correlates with Clinical Disability in Friedreich Ataxia, 62nd American Academy of Neurology Meeting, Apr 2010, Toronto, Canada, P03.221 (poster)
  7. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, C.L. Yasuda, G.C.S. Ruppert, Accurate and Precise Mid-Sagittal Plane Location in 3D MR Images of the Brain, III Workshop CinAPCe, Aug 2009, Ribeirão Preto, SP, Brasil, pp. 9-9
  8. F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, Focal Cortical Dysplasia Segmentation in 3D Magnetic Resonance Images of the Human Brain, XXII Concurso de Teses e Dissertações, XXIX Congresso da Sociedade Brasileira de Computação, Jul 2009, Bento Gonçalves, RS, Brazil, pp. 9-9
  9. F.P.G. Bergo, G.C.S. Ruppert, L.F. Pinto, A.X. Falcão, Fast and precise Mid-Sagittal Plane Location in 3D MR Images of the Brain, II Workshop CInAPCe, Jun 2008, Campinas, SP, Brazil, pp. 302-303.
  10. F.O. Favretto, F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, A Rigid Registration Method for 3D MR Images of the Human Brain, II Workshop CInAPCe, Jun 2008, Campinas, SP, Brazil, pp. 305-307.
  11. F. de Goes, F.P.G. Bergo, A.X. Falcão, S. Goldenstein, L. Velho, Dynamic Meshes for Deformable Surfaces, ACM SIGGRAPH'06, Aug 2006, Boston, MA, USA, poster #88.